多囊卵巢综合症是由月经调节机制失常所产生的一种综合症，其发病原因可能与下面三个因素有关：
引起多囊卵巢综合症的原因之一、垂体促性腺激素的分泌失调
丘脑下部通过持续中枢和周期中枢，控制垂体促性腺激素的分泌，在促卵泡成熟素(FSH)和黄体生成素(LH)的协同作用下，使卵泡发育、成熟和排卵。当病人由于情绪紧张、药物、疾病等因素引起丘脑下部的功能失调时，可使垂体分泌的LH/FSH失去正常比值，卵泡就不能发育成熟及排卵。由于FSH的持续少量刺激，使卵巢不断出现许多不成熟的囊状卵泡;LH的分泌持续高于正常，使卵泡膜细胞增生和黄素化，造成卵巢的多囊性病变。
引起多囊卵巢综合症的原因之二、肾上腺皮质功能紊乱
有些肾上腺肿瘤、肾上腺皮质增生或柯兴氏病时，也常伴随无排卵无类似多囊性卵巢的表现，经治疗后可恢复有周期性排卵的正常月经，故认为肾上腺的雄激素过量可引起多囊卵巢综合症。
引起多囊卵巢综合症的原因之三、卵巢类固醇生成所需酶系统的功能缺陷
有人认为多囊卵巢综合症可能是由于卵巢酶系统发生紊乱造成的，影响了丘脑下部周期中枢的功能，造成LH与FSH比例失常。
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